MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanobacterium sp. AL-21 chromosome

Total Repeats: 58826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015216	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015216	TTAA	2	8	43	50	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015216	AGA	2	6	87	92	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957760
4	NC_015216	GA	4	8	96	103	50 %	0 %	50 %	0 %	325957760
5	NC_015216	A	6	6	128	133	100 %	0 %	0 %	0 %	325957760
6	NC_015216	ACCA	2	8	271	278	50 %	0 %	0 %	50 %	325957760
7	NC_015216	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957760
8	NC_015216	GTAC	2	8	336	343	25 %	25 %	25 %	25 %	325957760
9	NC_015216	CAT	2	6	366	371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957760
10	NC_015216	TG	3	6	480	485	0 %	50 %	50 %	0 %	325957760
11	NC_015216	GAA	2	6	491	496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957760
12	NC_015216	ACA	2	6	504	509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957760
13	NC_015216	CAA	2	6	518	523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957760
14	NC_015216	TGA	2	6	582	587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957760
15	NC_015216	GAA	2	6	592	597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957760
16	NC_015216	ACT	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957760
17	NC_015216	GCC	2	6	640	645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325957760
18	NC_015216	AGGA	2	8	653	660	50 %	0 %	50 %	0 %	325957760
19	NC_015216	CCAG	2	8	716	723	25 %	0 %	25 %	50 %	325957760
20	NC_015216	AAC	2	6	970	975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957760
21	NC_015216	CTC	2	6	1005	1010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957760
22	NC_015216	ATT	2	6	1021	1026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957760
23	NC_015216	CATG	2	8	1037	1044	25 %	25 %	25 %	25 %	325957760
24	NC_015216	AGGAA	2	10	1177	1186	60 %	0 %	40 %	0 %	325957760
25	NC_015216	AAAC	2	8	1192	1199	75 %	0 %	0 %	25 %	325957760
26	NC_015216	T	7	7	1420	1426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015216	CCA	2	6	1427	1432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015216	CTA	2	6	1434	1439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015216	T	10	10	1474	1483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015216	T	6	6	1490	1495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015216	T	6	6	1519	1524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015216	A	6	6	1533	1538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015216	ATTT	2	8	1564	1571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015216	T	6	6	1569	1574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015216	ATTT	2	8	1579	1586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015216	AT	3	6	1727	1732	50 %	50 %	0 %	0 %	325957761
37	NC_015216	ATA	2	6	1748	1753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957761
38	NC_015216	ATG	2	6	1844	1849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957761
39	NC_015216	TAG	2	6	1878	1883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957761
40	NC_015216	CAAC	2	8	1894	1901	50 %	0 %	0 %	50 %	325957761
41	NC_015216	TGA	2	6	1983	1988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957761
42	NC_015216	TGG	2	6	1999	2004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957761
43	NC_015216	CTT	2	6	2014	2019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957761
44	NC_015216	ATG	2	6	2021	2026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957761
45	NC_015216	GCA	2	6	2066	2071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957761
46	NC_015216	AGC	2	6	2080	2085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957761
47	NC_015216	TTG	2	6	2123	2128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957761
48	NC_015216	GAT	2	6	2131	2136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957761
49	NC_015216	TGG	2	6	2233	2238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957761
50	NC_015216	TGAAC	2	10	2242	2251	40 %	20 %	20 %	20 %	325957761
51	NC_015216	TGT	2	6	2296	2301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957761
52	NC_015216	ATA	2	6	2315	2320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957761
53	NC_015216	ATT	2	6	2357	2362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957761
54	NC_015216	GTT	2	6	2429	2434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957761
55	NC_015216	ACA	2	6	2435	2440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957761
56	NC_015216	T	10	10	2552	2561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015216	AT	3	6	2565	2570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015216	TAAT	2	8	2613	2620	50 %	50 %	0 %	0 %	325957762
59	NC_015216	ATA	2	6	2660	2665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957762
60	NC_015216	GGA	2	6	2690	2695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325957762
61	NC_015216	AAAAT	2	10	2757	2766	80 %	20 %	0 %	0 %	325957762
62	NC_015216	A	6	6	2827	2832	100 %	0 %	0 %	0 %	325957762
63	NC_015216	AT	3	6	2934	2939	50 %	50 %	0 %	0 %	325957762
64	NC_015216	ATG	2	6	2952	2957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957762
65	NC_015216	GTT	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957762
66	NC_015216	TAATT	2	10	3000	3009	40 %	60 %	0 %	0 %	325957762
67	NC_015216	A	6	6	3015	3020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015216	TC	3	6	3073	3078	0 %	50 %	0 %	50 %	325957763
69	NC_015216	ATT	2	6	3127	3132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957763
70	NC_015216	TG	3	6	3193	3198	0 %	50 %	50 %	0 %	325957763
71	NC_015216	AGA	2	6	3259	3264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957763
72	NC_015216	TAGG	2	8	3339	3346	25 %	25 %	50 %	0 %	325957763
73	NC_015216	TAA	2	6	3351	3356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957763
74	NC_015216	CAC	2	6	3420	3425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957763
75	NC_015216	T	7	7	3467	3473	0 %	100 %	0 %	0 %	325957763
76	NC_015216	TTG	2	6	3501	3506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957764
77	NC_015216	TTC	2	6	3517	3522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957764
78	NC_015216	TTA	2	6	3564	3569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957764
79	NC_015216	GAT	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957764
80	NC_015216	CCA	2	6	3584	3589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957764
81	NC_015216	TAT	2	6	3601	3606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957764
82	NC_015216	TCC	2	6	3610	3615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957764
83	NC_015216	GTT	2	6	3782	3787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957764
84	NC_015216	TAT	2	6	3934	3939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015216	TAT	2	6	3959	3964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015216	ACT	2	6	3978	3983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325957765
87	NC_015216	TTA	2	6	3997	4002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957765
88	NC_015216	TAT	2	6	4010	4015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957765
89	NC_015216	TCC	2	6	4016	4021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957765
90	NC_015216	ATT	2	6	4029	4034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957765
91	NC_015216	CAA	2	6	4045	4050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957765
92	NC_015216	AATA	2	8	4061	4068	75 %	25 %	0 %	0 %	325957765
93	NC_015216	TGC	2	6	4082	4087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957765
94	NC_015216	TAT	2	6	4097	4102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957765
95	NC_015216	AAG	2	6	4127	4132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957765
96	NC_015216	AAAG	2	8	4137	4144	75 %	0 %	25 %	0 %	325957765
97	NC_015216	CCA	2	6	4203	4208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957765
98	NC_015216	ATT	2	6	4296	4301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957765
99	NC_015216	TCC	2	6	4348	4353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015216	CGATT	2	10	4358	4367	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015216	ATTG	2	8	4380	4387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015216	TAA	2	6	4448	4453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015216	AAT	2	6	4465	4470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015216	A	7	7	4517	4523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015216	T	7	7	4528	4534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015216	ATTA	2	8	4537	4544	50 %	50 %	0 %	0 %	325957766
107	NC_015216	AATT	2	8	4551	4558	50 %	50 %	0 %	0 %	325957766
108	NC_015216	TCC	2	6	4572	4577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957766
109	NC_015216	AACC	2	8	4583	4590	50 %	0 %	0 %	50 %	325957766
110	NC_015216	AAC	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957766
111	NC_015216	AT	3	6	4620	4625	50 %	50 %	0 %	0 %	325957766
112	NC_015216	CTG	2	6	4673	4678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957766
113	NC_015216	AAT	2	6	4759	4764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957766
114	NC_015216	CCAT	2	8	4765	4772	25 %	25 %	0 %	50 %	325957766
115	NC_015216	TTA	2	6	4787	4792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957766
116	NC_015216	ATTCCC	2	12	4813	4824	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	325957766
117	NC_015216	CAA	2	6	4857	4862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957766
118	NC_015216	AACCA	2	10	4914	4923	60 %	0 %	0 %	40 %	325957766
119	NC_015216	ATT	2	6	4935	4940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015216	TTA	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015216	A	6	6	4968	4973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015216	ATC	2	6	4988	4993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015216	TTA	2	6	5019	5024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015216	ATA	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015216	A	6	6	5150	5155	100 %	0 %	0 %	0 %	325957767
126	NC_015216	TGC	2	6	5156	5161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957767
127	NC_015216	TAA	2	6	5167	5172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325957767
128	NC_015216	A	6	6	5171	5176	100 %	0 %	0 %	0 %	325957767
129	NC_015216	ATT	2	6	5184	5189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957767
130	NC_015216	GAA	2	6	5250	5255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957767
131	NC_015216	AGA	2	6	5318	5323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957767
132	NC_015216	C	6	6	5335	5340	0 %	0 %	0 %	100 %	325957767
133	NC_015216	A	7	7	5376	5382	100 %	0 %	0 %	0 %	325957767
134	NC_015216	AAC	2	6	5399	5404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325957767
135	NC_015216	AGG	2	6	5510	5515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325957767
136	NC_015216	A	7	7	5609	5615	100 %	0 %	0 %	0 %	325957767
137	NC_015216	GTG	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325957767
138	NC_015216	AGG	2	6	5666	5671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325957767
139	NC_015216	GAA	2	6	5718	5723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957767
140	NC_015216	GAA	2	6	5739	5744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325957767
141	NC_015216	CTG	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325957767
142	NC_015216	GAT	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957767
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270	NC_015216	A	7	7	11997	12003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_015216	ATT	2	6	12052	12057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325957772
272	NC_015216	GTCA	2	8	12075	12082	25 %	25 %	25 %	25 %	325957772
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274	NC_015216	CTT	2	6	12283	12288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957772
275	NC_015216	TCC	2	6	12309	12314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325957772
276	NC_015216	T	6	6	12550	12555	0 %	100 %	0 %	0 %	325957772
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279	NC_015216	T	6	6	12645	12650	0 %	100 %	0 %	0 %	325957772
280	NC_015216	T	6	6	12750	12755	0 %	100 %	0 %	0 %	325957773
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307	NC_015216	T	6	6	14026	14031	0 %	100 %	0 %	0 %	325957773
308	NC_015216	AAT	2	6	14055	14060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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391	NC_015216	CCA	2	6	18224	18229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957776
392	NC_015216	TTC	2	6	18238	18243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957776
393	NC_015216	CT	3	6	18300	18305	0 %	50 %	0 %	50 %	325957776
394	NC_015216	TACC	2	8	18479	18486	25 %	25 %	0 %	50 %	325957776
395	NC_015216	CCATC	2	10	18507	18516	20 %	20 %	0 %	60 %	325957776
396	NC_015216	CTTT	2	8	18641	18648	0 %	75 %	0 %	25 %	325957776
397	NC_015216	TTG	3	9	18649	18657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325957776
398	NC_015216	ATC	2	6	18732	18737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
399	NC_015216	ATT	2	6	18790	18795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_015216	TGAAT	2	10	18826	18835	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
401	NC_015216	CAA	2	6	18855	18860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_015216	ATA	2	6	18861	18866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_015216	T	6	6	18926	18931	0 %	100 %	0 %	0 %	325957777
404	NC_015216	TCT	2	6	18987	18992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325957777
405	NC_015216	CCA	2	6	19012	19017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325957777
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432	NC_015216	T	6	6	19995	20000	0 %	100 %	0 %	0 %	325957778
433	NC_015216	T	6	6	20028	20033	0 %	100 %	0 %	0 %	325957778
434	NC_015216	ATTC	2	8	20083	20090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
435	NC_015216	ACTA	2	8	20185	20192	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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471	NC_015216	TGA	2	6	21637	21642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325957780
472	NC_015216	AGC	2	6	21650	21655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325957780
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